Как известно, одним из приоритетных направлений развития системы здравоохранения и социальной политики государства является изучение специфики первичной заболеваемости детей и подростков в определенной среде обитания человека с целью идентификации перспективных векторов профилактики в регионе. Целью работы было исследовать региональные особенности популяционного здоровья детского населения в субъектах Дальневосточного федерального округа (ДФО). Выполнено ретроспективное аналитическое исследование, изучены уровень и структура показателей первичной заболеваемости детского и подросткового населения в 11 субъектах ДФО. Установлено, что в структуре среднемноголетней первичной заболеваемости по классам болезней в ДФО среди детей 0–14 лет и подростков 15–17 лет лидирующие позиции занимали классы X («Болезни органов дыхания») и XIX («Травмы, отравления и некоторые другие последствия воздействия внешних причин»). Наименьшую первичную заболеваемость регистрировали по классу III («Болезни крови, кроветворных органов и отдельные нарушения, вовлекающие иммунный механизм»). Установлены значимые различия среднемноголетних уровней анализируемых показателей между возрастными группами в ДФО и значимые отличия от общероссийских показателей. Полученные данные могут быть применены для прогнозирования состояния здоровья подрастающего поколения и определения стратегического направления развития системы здравоохранения в макрорегионе.