Воздействие современных факторов образовательной среды и внеучебных факторов обуславливает риски возникновения и прогрессирования функциональных отклонений и хронических заболеваний костно-мышечной системы, болезней глаза и его придаточного аппарата у обучающихся. Целью работы было обосновать программы гигиенического воспитания в части соблюдения гигиенических рекомендаций по вопросам профилактики возникновения болезней костно-мышечной системы, глаза и его придаточного аппарата посредством анализа научных публикаций. Проведен обзор выполненных в 2011–2023 гг. исследований российских и зарубежных специалистов, рассматривающих влияние факторов образовательной среды и компонентов режима дня на состояние здоровья обучающихся, с использованием электронных баз данных E-Library, PubMed, Web of Science. Показано влияние таких факторов риска, как нерациональная организация режима дня на здоровье обучающихся общеобразовательных организаций, организаций среднего профессионального и высшего образования. Оценены риски развития нарушений костно-мышечной системы, болезней глаза и придаточного аппарата, обусловленные избыточным нахождением в условиях цифровой среды, недостатком двигательной активности, нерациональной организацией досуга. Необходима разработка предполагающих участие педагогов, преподавателей и родителей программ гигиенического воспитания обучающихся, направленных на предупреждение влияния факторов риска развития болезней костно-мышечной системы, глаза и его придаточного аппарата.