Отражающий стресс уровень кортизола у студентов связан с проявлениями тревожности и депрессии, что важно с точки зрения гигиенической оптимизации учебного процесса. Целью исследования было оценить взаимосвязь уровня кортизола в крови студентов с тревожно-депрессивными состояниями на разных этапах обучения. В сравнительном поперечном исследовании приняли участие 200 студентов 1-го курса, обучавшихся в 2023–2024 учебном году. Уровень кортизола в сыворотке крови определяли методом иммуноферментного анализа (ИФА), для выявления тревожно-депрессивных состояний использовали шкалу HADS. Признаки тревоги и депрессии по этапам обучения выявлены у 34,4–43,6% (р = 0,189) и  18,2–24,7% (р = 0,256) студентов. В конце года обучения доля клинически выраженной формы в структуре тревоги увеличилась на 19,3%, в структуре депрессии ― на 4,3%.  Показатели кортизола при тревоге весной выше, чем осенью, ― на 32,3% (р = 0,001), в том числе при субклинической форме на 35,3% (р = 0,001), при клинически выраженной форме на 28,4% (р = 0,028); при депрессии весной они выше на 53,9% (р = 0,001), в том числе при субклинической форме на 55,4% (р = 0,001), при клинически выраженной форме на 45,6% (р = 0,052). Ассоциация уровня кортизола с тревогой осенью отсутствует (r = 0,07, р = 0,488), весной она умеренная прямая (r = 0,51, p = 0,001), в том числе у девушек осенью r = 0,03, р = 0,771, весной r = 0,49, р < 0,001, а у юношей осенью r = 0,18, р = 0,296, весной r = 0,57, р = 0,001 соответственно. Нелинейная логарифмическая модель показала значимый эффект тревожности (F = 16,26, p < 0,001), объясняющий 7,7 % дисперсии. Результаты исследования имеют значение для разработки профилактических программ, направленных на управление стрессовой нагрузкой студентов.